元气骑士中武器融合是通过特定操作将两把或三把符合条件的武器组合成新武器的系统。玩家需要在地牢环境中进行融合操作，骑士之家无法完成该过程。融合前需确保武器不带配件，否则配件会被消耗。融合按钮会在满足条件时出现在屏幕右下角，呈现漩涡状标志，点击即可完成融合。武器融合的核心机制是同品质武器的组合升级，不同武器组合会产生不同效果的新武器。
三把武器的融合需要特殊操作方式，玩家需同时携带三把武器进入地牢。标准方法是背上一把武器、地上放置一把武器、手上持有一把武器。骑士职业的二技能全力攻击可以卡出携带三把武器的特性，这是经过官方默认可行的特殊操作方式。具体操作为在花园种植作物后，开启技能拾取作物，再拾取第三把武器即可实现三持状态。这种多武器携带方式为高级武器融合提供了必要条件。
雪狐系列武器可通过逐级融合升级，如雪狐+雪狐=大雪狐；光剑类武器中，红蓝光剑融合会产生光剑紫，三色光剑融合则生成光剑土豪金。元素武器组合能产生特殊效果，如冰霜剑与火焰剑融合生成雷剑。远程武器如弓箭类，英雄弓与风之弓可融合为魔法弓，三把不同属性弓能合成群星之弓。这些合成公式构成了游戏内完整的武器进化体系。
融合武器的强度与原始武器品质直接相关。部分融合武器如雷剑、光剑土豪金具有接近红色武器的性能，但需要特定天赋支持才能发挥最大效果。武器融合系统为玩家提供了装备定制化路径，通过合理搭配原始武器和天赋，可以创造出适应不同战斗场景的强力装备。部分融合武器如嘤嘤鹰更侧重娱乐性而非实战价值，这是游戏设计中的多样性体现。
武器融合后的新武器需要重复获取八次才能解锁锻造台制作权限，这是游戏设定的收集要素。玩家可通过多次融合同种武器来达成该条件，但部分特殊融合武器如雪狐玫瑰金不受此限制。融合系统与游戏其他机制如天赋选择、配件装配形成深度联动，共同构成了元气骑士丰富的装备构建体系。掌握武器融合技术是玩家提升战斗效率、挑战高难度关卡的重要途径。
