黑暗星系是游戏中的一个转折点，标志着玩家将面对更加复杂和艰难的挑战。而在黑暗星系中，最让玩家谈之色变的便是“影之试炼”关卡。这个关卡的特点是它的环境设定，玩家的视野将受到极大限制，只能看到周围有限的区域。这就需要玩家要拥有极佳的记忆力和空间感，才能在黑暗中找到正确的前进路径。关卡中还会时不时出现各种障碍和敌人，这就需要玩家在摸索前进的还要不断应对突如其来的战斗，挑战难度非常之高。
在这个看似寒冷而宁静的星系中，隐藏着一个令人头疼的关卡——“密码解锁”。该关卡要求玩家解开一系列复杂的密码才能继续前进。这些密码不仅包括传统的数字组合、图形匹配，甚至还会涉及到音乐节奏和逻辑推理。这就要求玩家必须具备多方面的知识和技能，才能在限定时间内解开所有的密码。关卡中还会设置各种干扰项，尽可能地分散玩家的注意力，进一步增加了解码的难度。
“混沌星系”名不虚传，其中的“恒星迷宫”更是玩家进入混沌星系后的首个大难关。这个关卡模拟了一个由无数恒星构成的巨大迷宫，玩家需要在这个迷宫中找到正确的路径，才能找到出口。迷宫的结构极其复杂，充满了死路和循环路线，一不小心就会陷入重复的路径中无法自拔。在迷宫中还散布着各种敌人和陷阱，一旦不慎被捕获，就会遭受重创，甚至直接导致任务失败。只有具备极强的记忆力和方向感，结合周密的策略和快速的反应，才有可能攻克这个几乎是对所有能力的综合考验的迷宫。
时间星系是一个以时间为主题的独特星系，其中“逆流之战”关卡以其特殊的战斗模式成为众多玩家的难题。在这个关卡中，玩家不仅要对抗强大的敌人，还要在有限的时间内完成战斗。这里的时间并非单纯流逝，而是会随着战斗的进程发生变化，甚至出现倒流的情况。这就要求玩家在进行战斗策略规划时，不仅考虑如何战胜敌人，还要考虑如何在不断变化的时间流中把握战斗节奏，这无疑增加了关卡的复杂度和挑战性。
在《赛尔号超级英雄星系》的所有挑战中，位于终极星球的“黑洞边缘”关卡可谓是壮志凌云，它是通往终极boss的必经之路。这个关卡的挑战在于，玩家需要在黑洞的强大引力作用下，控制好自己的行动轨迹，既要躲避来自黑洞的吸引，又要对抗由黑洞引发的各种宇宙异常现象，如时空扭曲、物质裂解等。还要面对由黑洞引来的各种守卫者的挑战。这个关卡考验的是玩家的操作技巧和战略布局能力，通过这个关卡，几乎意味着玩家已经具备了成为顶尖赛尔战士的实力。
《赛尔号超级英雄星系》中的这些关卡，以其独特的设计和极高的挑战性，为广大玩家提供了无与伦比的游戏体验。它们不仅考验玩家的反应速度和操作技巧，更考验玩家的耐心、智慧和策略。虽然这些关卡可能会让许多玩家遭遇挑战，甚至一度感到挫败，但正是这种挑战，才让《赛尔号超级英雄星系》这款游戏变得更加深邃和有趣，成为了一款真正能够吸引玩家深入探索的游戏。
